Comment construire un graphical abstract efficace en 3 étapes ?

Sommaire

Introduction

Un graphical abstract est une image unique qui accompagne vos publications et/ou vos revues pour comprendre immédiatement le message à retenir.

Ce visuel est de plus en plus demandé par les journaux scientifiques. Il apparait dans les listes de résultats de recherche en ligne ainsi que l’article en ligne mais, généralement il n’apparaît pas dans le fichier PDF pour l’impression de l’article.

Cette figure est un résumé concis et illustré des principales méthodes et conclusions de votre article.

Il va permettre aux lecteurs et lectrices de comprendre d’un seul coup d’œil le sujet de votre papier et le contenu que vous allez potentiellement développer.

Ce visuel permet d’augmenter la curiosité et l’intérêt de votre public cible. Il l’aide à identifier plus rapidement votre article, en pré-visualisant votre étude, pour décider de poursuivre ou non sa lecture.

🚀 Les papiers contenant des graphical abstracts sont plus visités et partagés sur les réseaux sociaux. En effet, une étude a montré que les articles possédant un graphical abstract ont 2 fois plus de chance d’être consultés et 8 fois plus de chance d’être retweetés : Lien vers l’étude

Pour résumer, les avantages de créer un graphical abstract sont :

✅  Capter l’attention du lecteur qui ne peut pas lire l’article dans sa totalité.

✅  Présenter la méthodologie parfois complexe dans un format plus compréhensible.

✅  Augmenter la présence de votre article sur les réseaux sociaux.

✅  Augmenter la consultation de votre article.

Je vais donc vous partager quelques astuces pour vous aider à réaliser un graphical abstract en 3 étapes :

1 : Identifier les idées clés.

2 : Définir les composants à illustrer et réaliser un croquis.

3 : Créer le design.

À l’aide d’un exemple concret, je vais vous proposer quelques conseils pour créer un graphical abstract convaincant !

Bonne lecture !

Étape 1 : Identifier les idées clés

Pour commencer à construire votre graphical abstract, il faut que vous déterminiez les idées clés de votre publication ou de votre revue.

À priori, vous avez déjà fait un résumé écrit qui reprend brièvement les concepts principaux de vos recherches. Il vous sera très utile pour souligner les mots-clés qui constitueront les éléments les plus pertinents à inclure dans votre visuel.

Pour vous donner un exemple, nous allons voir ensemble comment réaliser le graphical abstract de la publication ci-dessous.

Pour nous aider, nous pouvons nous appuyer sur le résumé texte de cette publication. Les auteurs ont déjà fait un tri dans leurs données pour mettre en avant les informations essentielles à la compréhension du contenu de leur article. Afin de sélectionner les mots-clés, posons-nous aussi les questions suivantes :

✅  Quel est le message principal ?

✅  Quel est l’objectif de l’étude ?

✅  Comment l’étude a‑t-elle été réalisée ?

✅  Quels sont les résultats majeurs ?

A simple, quick, and efficient CRISPR/Cas9 genome editing method for human induced pluripotent stem cells

Bing-chuan Geng, Kyoung-Han Choi, Shan-zhi Wang, Peng Chen, Xiu-di Pan, Nian-guo Dong, Jae-Kyun Ko, Hua Zhucorresponding. Acta Pharmacol Sin. 2020 Nov ; 41(11): 1427–1432.

Induced pluripotent stem cells (iPSCs) have become an essential research platform to study different human diseases once being discovered by Dr. Shinya Yamanaka in 2006. Another breakthrough in biomedical research is the application of CRISPR/Cas9 system for genome editing in mammalian cells. Although numerous studies have been done to develop methods for gene editing in iPSCs, the current approaches suffer from several limitations, including time and labor consuming, low editing efficiency, and potential off-target effects. In the current study, we report an electroporation-mediated plasmid CRISPR/Cas9 delivery approach for genome editing in iPSCs. With this approach, an edited iPSC cell line could be obtained within 2 weeks. In addition, the transit introducing of CRISPR/Cas9 machinery could minimize genomic integration of Cas9 gene, which avoided potential long-term side effects of Cas9 enzyme. We showed that CRISPR/Cas9-mediated genomic editing did not affect pluripotency and differentiation ability of iPSCs. With the quickly evolving of both iPSC and CRISPR/Cas9-mediated genome editing research fields, we believe that our method can significantly facilitate the application of genome editing in iPSCs research.

Après la lecture du résumé et de l’ensemble du texte de la publication, nous pouvons en déduire les informations essentielles suivantes :

➡️ Dans cette publication, l’objectif au cœur de leur démarche scientifique est de mettre en avant leur méthode d’édition du génome par CRISPR/Cas9 dans les cellules souches pluripotentes induites.

➡️ Les cellules souches pluripotentes induites (iPSCs en anglais) peuvent se différencier en différents types cellulaires. Elles permettent de remplacer les cellules souches embryonnaires. Elles sont utilisées par les médecins et les chercheurs afin de réaliser des modèles cellulaires spécifiques aux patients et de cribler de potentiels médicaments pour une médecine personnalisée. Elles peuvent aussi être employées afin d’identifier les mutations génétiques à l’origine d’une maladie.

➡️ Selon les auteur·e·s, le système CRISPR/Cas9 est l’approche la plus couramment utilisée pour l’édition du génome, mais avec le protocole conventionnel, il possède plusieurs limitations comme :

  • Le temps et la main d’œuvre importante.
  • La faible efficacité d’édition.
  • Les effets potentiels hors cible.

➡️ Avec leur protocole simplifié, les cellules souches pluripotentes induites modifiées génétiquement peuvent être obtenues en 2 semaines seulement. En effet, cette méthode requière une étape de sélection à base d’antibiotique, mais relativement courte puisqu’elle utilise une concentration légèrement élevée et une période de traitement réduite. Grâce à cette sélection rapide, l’intégration du gène Cas9 est minimisé, évitant ainsi les effets potentiels hors cible par l’expression à long terme de Cas9. Enfin, cette technique n’affecte ni la pluripotence, ni la capacité de différenciation des cellules souches.

Pour résumer, les auteur·e·s mettent en valeur leur protocole d’édition du génome utilisant CRISPR/Cas9 sur les iPSCs. Au moyen de leur méthode, le temps d’obtention des cellules est accéléré, elles peuvent être obtenues en seulement 2 semaines. Grâce à cette technique le gène Cas9 ne s’intègre pas, évitant ainsi les effets potentiels hors cible.

Étape 2 : Définir les composants à illustrer et réaliser un croquis

Dans la partie précédente, nous avons souligné les mots clés et noté les idées principales à intégrer dans le graphical abstract .

Premièrement, je vous propose de lister ci-dessous les éléments à illuster pour définir les représentations graphiques les plus appropriées :

  • Les cellules souches pluripotentes induites > Illustration
  • L’édition du génome par CRISPR/Cas9 > Illustration
  • Le protocole de la méthode pour obtenir les cellules en 2 semaines > Illustration/Infographie
  • Les avantages de cette technique > Infographie

Dans un deuxième temps, je vous propose d’utiliser la structure suivante qui s’appuie sur un sens de lecture logique du haut vers le bas et de gauche à droite :

  • Le titre (en haut) qui reprend l’objectif principal de l’article.
  • Les 3 points essentiels à la compréhension du texte (au milieu) qui sont : le contexte, la méthode et les résultats.
  • Le logo (en bas à gauche) de la structure qui a créé le graphical abstract (l’équipe, le laboratoire, le journal…).
  • Les autheur·e·s (en bas à droite).

Avant d’utiliser un logiciel graphique pour réaliser le design, je vous conseille de commencer par faire un croquis. Il va vous permettre d’agencer les éléments entre eux. Grâce à lui, vous allez savoir si votre visuel est simple à comprendre et cohérent.

Étape 3 : Créer le design

Avant de débuter cette étape, vous allez devoir choisir un logiciel graphique (Powerpoint, Adobe Illustrator, Inkscape…). Une fois que ce choix est fait, vous pouvez passer à la création !

Lors de la création, vous allez devoir faire attention à plusieurs points qui vont dépendre du journal scientifique dans lequel vous soumettez l’article :

🖼️ Taille de l’image et résolution

Selon Elsevier : 1328 x 531 pixels (300 dpi).

Selon CellPress : 1200 x 1200 pixels (300 dpi).

✒️ Police d’écriture

Utilisez une police facile à lire (par exemple : Times New Roman, Arial, Courier ou Symbol) et de taille appropriée (supérieure à 10 points).

🎨 Palette de couleurs

Choisissez des couleurs cohérentes par rapport à votre sujet et qui peuvent être complémentaires du site web du journal scientifique. Évitez les couleurs primaires ou fortement saturées.

🖥️ Type de fichier

Généralement vous pouvez exporter votre visuel en TIFF, EPS, PDF ou JPEG.

Pour notre exemple, j’ai choisi la typographie Arial et le format proposé par Elsevier à savoir 1328 x 531 pixels. En respectant l’ensemble des consignes, je me suis prêtée à l’exercice de création à l’aide du logiciel Adobe Illustrator. Ci-dessous, je vous propose ce graphical abstract qui peut résumer visuellement la publication !

Conclusion

Dans cet article, nous avons vu ce qu’était un graphical abstract et les avantages d’en utiliser. Je vous ai aussi partagé une méthode en 3 étapes pour créer vos propres visuels !

En résumé, ces graphical abstracts sont de plus en plus adoptés pour diffuser la recherche scientifique. Ce sont des outils de communication au potentiel énorme s’ils sont bien pris en main. Du fait de leur avantage à transmettre un message de façon efficace et claire, leur emploi continuera de croitre. La communauté scientifique doit alors s’en emparer pour mettre en avant son travail et augmenter la visibilité de ses recherches.

J’espère vous avoir convaincu de la nécessité de vous servir de ce type de représentations visuelles pour promouvoir vos études. Je vous encourage aussi à lire cet article sur les graphical abstracts qui décrit pourquoi et comment vous pouvez les employer : Lien vers l’article

Si vous avez besoin d’aide pour créer des figures scientifiques professionnelles, je propose des services de graphisme et d’illustration scientifique. Avec une expertise dans la création de visuels clairs, concis et esthétiquement agréables, je peux vous aider à représenter visuellement vos données de recherche de manière efficace. N’hésitez pas à me contacter pour discuter de vos besoins et des possibilités de collaboration.

Émilie Josse — Graphiste scientifique & Illustratrice

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